SARS-CoV-2 P681R und E484Q

SARS-CoV-2 P681R und E484Q

Themenübersicht

Allgemeines

  • Besorgniserregende Virusvarianten (variants of concern, VOC) sind Virusvarianten, die sich in ihren Erregereigenschaften wie beispielsweise der Übertragbarkeit, der Virulenz, oder der Suszeptibilität gegenüber der Immunantwort von genesenen oder geimpften Personen relevant von den herkömmlichen Virusvarianten unterscheiden.
  • Den Vorgaben der kassenärztlichen Bundesvereinigung zur Verordnung zur molekulargenetischen Surveillance des Coronavirus SARS-Cov-2 entsprechend erfolgt die Bestimmung bei Virusnachweis.

Indikation

Bei Nachweis von SARS-CoV-2 erfolgt die Bestimmung der Markermutation N501Y, E484K und der Deletion 69/70 in Abhängigkeit der epidemiologischen Lage

Material

Universalabstrich

eSwab Applikator mit Tupfer in Standardgröße
eSwab Applikator mit mini-Tupfer
eSwab Applikator mit flexiblem Nasopharyngeal-Tupfer
alternativ:
Trockener Abstrichtupfer
alternativ:
Sputumbecher
alternativ:
Rachenspülwasser
  • Abstriche sollten möglichst nicht mit Blut kontaminiert sein oder dem Sonnenlicht ausgesetzt werden.

Durchführung

Durchführungsort/-orte:

MZLA - Standort Altenburg

Referenzbereich

negativ

Beurteilung der Ergebnisse

Meldepflicht:

Bei positivem Nachweis erfolgt eine namentliche Meldung an das Gesundheitsamt, sofern der direkte oder indirekte Nachweis auf eine akute Infektion hinweist.

Mutation:

P681Q
E484Q
Variante
Im Zweifel sollte eine Vollgenomsequenzierung durchgeführt werden.
–
–
Kein Hinweis auf das Vorliegen der „indischen“ Variante
–
+
Kein Hinweis auf das Vorliegen der „indischen“ Variante. In < 20 % der Sequenzierungen tritt diese Konstellation bei den Varianten B.1.1.359, P.4 oder B.1.1.29 auf.
+
–
Verdacht auf das Vorliegen der Delta- Variante (B.1.617.2, AY.1 oder AY.2)
+
+
Hinweis auf das Vorliegen der „indischen“ Varianten (B.1.617, B.1.617.1 (Kappa) oder B.1.617.3), aber nicht auf die Deltavariante (B.1.617.2).

Grenzen des Verfahrens

  • Insbesondere bei niedriger Viruskonzentration in der Probe können invalide Ergebnisse entstehen.
  • Ergebnisse sollten mit einer SARS-CoV-2-Sequenzierung verifiziert werden.

Weiterführende Untersuchungen

Methode

Methodenbeschreibung
Methode
qPCR
Gerät
cobas 6800

SOP

Literatur

  • Herstellerangaben
  • RKI: https://www.rki.de/DE/Content/InfAZ/N/Neuartiges_Coronavirus/Virusvariante.html, Zugriff am 04.08.2021