CA 50 gilt als Tumormarker zur Verlaufskontrolle von Pankreas- und Gallengangskarzinomen bei Patienten, die aufgrund des fehlenden Lewis-Blutgruppenantigens a CA19-9 nicht exprimieren.

CA 50 wird durch Fucosylierung in CA 19-9 umgewandelt und entspricht dessen membranständiger Vorstufe. Eine kombinierte Bestimmung von CA 50 und CA 19-9 wird nicht empfohlen.